יונה – כינוי לעם ישראל. מה תהגי ומה תהמי – מדוע תקראי ותבכי. הפועל 'הוגה' מיוחד ליונים, והפועל 'הומה' מוכר במקרא כקול קריאה כללי של בעלי חיים, למשל: "נֶהֱמֶה כַדֻּבִּים כֻּלָּנוּ וְכַיּוֹנִים הָגֹה נֶהְגֶּה" (ישעיהו נט,יא). חגייך חגי – חגגי. נדרך שלמי – עלי לארץ ישראל. לפי דברי הנביא: "הִנֵּה עַל הֶהָרִים רַגְלֵי מְבַשֵּׂר מַשְׁמִיעַ שָׁלוֹם חָגִּי יְהוּדָה חַגַּיִךְ שַׁלְּמִי נְדָרָיִךְ" (נחום ב,א).

העוד לי תקווה – היא שואלת בנימה של יאוש, האם יש לה סיכוי לצאת מהגלות המדומה לשבי. ולהשיג תאווה על הר הצבי – תכלית השיבה לארץ ישראל היא העלייה להר בית ה'. תראוני – לשון שיר השירים א,ו: "אַל תִּרְאוּנִי שֶׁאֲנִי שְׁחַרְחֹרֶת. דווה – חולה, לפי איכה א,יג: "נְתָנַנִי שֹׁמֵמָה כָּל הַיּוֹם דָּוָה". מנוד – מנדודים. אוהבי – האל. למה תקראנה לי עוד נעמי – לפי רות א,כ: "אַל תִּקְרֶאנָה לִי נָעֳמִי קְרֶאןָ לִי מָרָא כִּי הֵמַר שַׁדַּי לִי מְאֹד".

אבר – כנף, ולפי הפסוק: "וָאֹמַר מִי יִתֶּן לִי אֵבֶר כַּיּוֹנָה אָעוּפָה וְאֶשְׁכֹּנָה" (תהילים). תילי – סמל לישיבה במקום בטוח: "וְנִבְנְתָה עִיר עַל תִּלָּהּ וְאַרְמוֹן עַל מִשְׁפָּטוֹ יֵשֵׁב" (ירמיהו ל,יח). לקרוא לי דרור – להוציא אותי לחופשי, לפי הפסוק: "לִקְרֹא דְרוֹר אִישׁ לְרֵעֵהוּ" (ירמיהו לד,טו). ועפר היכלי ארקח מור-דרור – אעשה מעפר הריסות המקדש תערובת בשמים. מור-דרור – טיפות של בושם מור, לפי הפסוק: "וְאַתָּה קַח לְךָ בְּשָׂמִים רֹאשׁ מָר דְּרוֹר חֲמֵשׁ מֵאוֹת" (ל,כג). המשורר משתמש בשלוש משמעויות שונות של המילה "דרור". אשק מאהבה מדרך פעמי – אנשק את עפרה של ארץ ישראל מאהבתי אליה, כדברי המשורר בשירו 'יפה נוף': "וְטַעַם רְגָבַיִךְ לְפִי מִדְּבַשׁ יֶעְרָב".

דייך – דברי הדוד. יגן בעדך – יגן עלייך, לפי הפסוק: "וְאַתָּה יְהֹוָה מָגֵן בַּעֲדִי" (תהילים ג,ד). ובארץ חושכך – בגלות. יכין צעדך – יכוון את דרכך, לפי הפסוק: "וַיהֹוָה יָכִין צַעֲדוֹ" (משלי טז,ט). שופר אל חיכך – השופר מסמל את הגאולה: "וְהָיָה בַּיּוֹם הַהוּא יִתָּקַע בְּשׁוֹפָר גָּדוֹל וּבָאוּ הָאֹבְדִים בְּאֶרֶץ אַשּׁוּר וְהַנִּדָּחִים בְּאֶרֶץ מִצְרָיִם" (ישעיהו כז,יג). כי בא מועדך – מועד הגאולה, לפי תהילים קב,יד: "אַתָּה תָקוּם תְּרַחֵם צִיּוֹן כִּי עֵת לְחֶנְנָהּ כִּי בָא מוֹעֵד". דברי על ליבך נחמי נחמי – לפי הנבואה: "נַחֲמוּ נַחֲמוּ עַמִּי יֹאמַר אֱלֹהֵיכֶם. דַּבְּרוּ עַל לֵב יְרוּשָׁלִַם וְקִרְאוּ אֵלֶיהָ" (ישעיהו מ,א-ב).
השם את פניי אל... הר סיני – דברי הרעיה. האל שהנחה אותי אל הר סיני. ישמיע – הוא ישמיע לי את בשורת הגאולה. מיטב מענה – מיטב השיר. כי ידע שמי – זכר אותי וגאלני, על פי הפסוק: "כִּי בִי חָשַׁק וַאֲפַלְּטֵהוּ אֲשַׂגְּבֵהוּ כִּי יָדַע שְׁמִי" (תהילים צא,יד) ובמשמעות שונה.